Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ErfP70459 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ErfP70459 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ErfP70459 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ErfP70459 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ErfP70459 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ErfP70459 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms