Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms