Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx3P70354 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms