Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms