Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfixP70257 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfixP70257 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfixP70257 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfixP70257 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfixP70257 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfixP70257 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfixP70257 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfixP70257 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfixP70257 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfixP70257 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms