Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms