Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkacbP68181 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms