Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpcal1P62748 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms