Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta2P62737 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Acta2P62737 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms