Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tbpl1P62340 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbpl1P62340 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms