Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms