Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms