Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Depdc5P61460 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Depdc5P61460 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms