Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Megf8P60882 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms