Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ActbP60710 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ActbP60710 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms