Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfia3P60469 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms