Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pcif1P59114 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcif1P59114 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms