Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms