Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tpm2P58774 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms