Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms