Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NcstnP57716 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NcstnP57716 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms