Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms