Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms