Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms