Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cux1P53564 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cux1P53564 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux1P53564 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cux1P53564 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cux1P53564 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux1P53564 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux1P53564 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cux1P53564 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux1P53564 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux1P53564 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux1P53564 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux1P53564 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux1P53564 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms