Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp1P52624 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms