Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClgnP52194 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms