Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms