Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms