Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms