Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5P49615 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms