Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PtpreP49446 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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