Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl11P48298 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl11P48298 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl11P48298 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl11P48298 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms