Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl13P47963 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl13P47963 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms