Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gli1P47806 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gli1P47806 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms