Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms