Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms