Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stt3aP46978 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stt3aP46978 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms