Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn1bP46414 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn1bP46414 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms