Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms