Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms