Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NodalP43021 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NodalP43021 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NodalP43021 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NodalP43021 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NodalP43021 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms