Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TfamP40630 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TfamP40630 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TfamP40630 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TfamP40630 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TfamP40630 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms