Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ThpoP40226 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms