Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms