Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspa9P38647 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspa9P38647 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms