Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ly6dP35459 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6dP35459 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms