Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2aP34056 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms