Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms