Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms